事变以后，明世宗加强防御措施，改十二团营为三大营﹐总三营为戎政府；修建北京外城﹐置蓟辽总督大臣，辖蓟州﹑保定﹑辽东三镇，募山东、山西﹑河南诸道兵岁集京师防秋，秋后散去﹐以为定制﹔又选各边镇锐卒入卫京师，以京营将分练边兵。明代北部边防逐渐加强。
庚戌之变是蒙古对明朝发动的大规模战争。战争的起因、经过、结局无不与明、蒙双方贸易联系的恢复及发展息息相关，故明蒙之间的经济贸易交流作为维系双方和平交往的纽带是无法斩断的。这正是庚戌之变的实质所在。
（明史）扩展阅读嘉靖二十九年夏六月，奄答寇大同境，溃墙入。悉精兵伏沟壑中，而以老弱百骑往来为饵。侦骑信之，报总兵张达。达素以果锐敢入至大将，意轻之。合兵，兵未合，而遽率麾下驰击之。伏发，围达数匝。马蹷，遂见杀。副帅林椿闻达被围，不介马而驰，救达不克，亦死之。达、椿皆骁勇善战，奄答得二将首，辄引去。事闻，逮总督侍郎郭宗皋、巡抚都御史陈耀下狱。耀杖死，宗皋谪戍辽左。赠达左都督，椿都督同知，赐祀立祠，春秋祀之。
